分子蒸餾是一種在高真空環境下，利用不同物質分子平均自由程差異實現分離的技術，特別適用于高沸點、熱敏性、易氧化物料的提純，其操作溫度遠低于常壓沸點且物料受熱時間極短。
分子蒸餾（又稱短程蒸餾）并非基于傳統蒸餾的沸點差分離原理，而是一種特殊的液-液分離技術。它通過創造真空環境（通常0.001–1 mbar），使輕組分分子的平均自由程大于蒸發面與冷凝面之間的距離，從而讓輕分子直接飛抵冷凝面被收集，而重組分因無法到達而被分離 。這一特性使其成為處理常規方法難以分離物質的關鍵手段。
工作原理詳解
分子蒸餾的核心在于“分子平均自由程"的差異：
分子平均自由程（λ）：指分子在兩次連續碰撞之間所走的平均距離，其值與壓力成反比，壓力越低，λ越大。
在超高真空下，物料被加熱形成極薄液膜（0.01–0.1 mm）。輕分子（小分子、低沸點組分）逸出后能順利抵達冷凝面并冷凝；重分子（大分子、高沸點組分）則因平均自由程短，在飛行中與其他分子或器壁碰撞，最終沿蒸發面流下，實現高效分離 。
整個過程無需沸騰，避免了氣泡產生和高溫分解，屬于物理分離過程，不污染物料